Органи на управление на Асоциацията по ВиК – Бургас са:
1. Общо събрание, което се състои от представител на държавата и общините;
2. Председател на Асоциацията по ВиК – Бургас е представителят на държавата, т.е. Областен управител на област Бургас.

№ по редЧленове на АВиК БургасПроцентно съотно­шение %
1Държавата35
2Община Айтос4.35
3Община Бургас32.56
4Община Камено1.69
5Община Карнобат3.57
6Община Малко Търново0.48
7Община Несебър4.89
8Община Поморие4.43
9Община Приморско1.02
10Община Руен4.32
11Община Созопол2.22
12Община Средец2.23
13Община Сунгурларе1.78
14Община Царево1.46
  100

Структура на администрацията на асоциацията:
– Главен секретар
– ВиК експерт
– Финансов експерт